管軼等人在穿山甲身上找到冠狀病毒,為新冠病毒亞型分支


來(lái)源:中國(guó)產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟(jì)信息網(wǎng)   時(shí)間:2020-02-21





  新型冠狀病毒COVID-19從哪里起源,又是如何從自然界傳播給人類,自從新冠肺炎疫情爆發(fā)后,這一問(wèn)題一直被大眾追問(wèn)。病毒溯源對(duì)揭示新冠病毒來(lái)源及其進(jìn)化規(guī)律、消除疫情源頭和防止疫情擴(kuò)散非常重要。

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  根據(jù)此前官方消息,目前的檢測(cè)結(jié)果可以初步排除新型冠狀病毒來(lái)源于家禽家畜。中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所對(duì)新冠病毒基因組序列的比對(duì)顯示,蝙蝠最有可能是新冠病毒的天然宿主。


  但是,從根據(jù)對(duì)蝙蝠身上發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒與COVID-19新型冠狀病毒的對(duì)比發(fā)現(xiàn),兩者基因組存在差異,這也意味著COVID-19新型冠狀病毒的進(jìn)化從蝙蝠到人,中間還至少差了一環(huán),即所謂的中間宿主。


  華南農(nóng)業(yè)大學(xué)2月7日宣布,發(fā)現(xiàn)穿山甲是新型冠狀病毒疫情的潛在中間宿主,但華南農(nóng)業(yè)大學(xué)方面進(jìn)一步表示,相關(guān)研究還尚未完成,研究結(jié)果尚未正式發(fā)表。也有專家推測(cè),蛇可能會(huì)是潛在的中間宿主。


  允許生命科學(xué)的研究人員發(fā)布預(yù)印本的交互式數(shù)據(jù)庫(kù)BioRxiv,最近發(fā)表了題為《Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China》(南中國(guó)馬來(lái)亞穿山甲中對(duì)2019新型冠狀病毒相關(guān)冠狀病毒的鑒定)的最新研究論文,該論文通訊作者為香港大學(xué)新發(fā)傳染性疾病國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任以及流感研究中心主任管軼教授,以及廣西醫(yī)科大學(xué)胡艷玲教授。


  論文研究結(jié)果顯示,在穿山甲中發(fā)現(xiàn)了與COVID-19新冠病毒相關(guān)的冠狀病毒,這有望進(jìn)一步揭示新冠病毒的起源與進(jìn)化之路。


  這是繼華南農(nóng)業(yè)大學(xué)之后,再次有研究學(xué)者提出穿山甲的新冠病毒“中間宿主”角色。


  本次研究的對(duì)象為2017年8月至2018年1月期間廣西海關(guān)在反走私行動(dòng)中查獲的18個(gè)冷凍穿山甲的(肺,腸,血液)等43個(gè)組織樣品,以及2018年5月至7月之間收集的一批12只穿山甲的19個(gè)穿山甲樣品。


  研究人員通過(guò)對(duì)這兩批穿山甲樣本分別進(jìn)行了高通量基因測(cè)序與qPCR檢測(cè),發(fā)現(xiàn)第一批樣本中的六個(gè)(兩個(gè)肺,兩個(gè)腸,一個(gè)肺腸混合物,一個(gè)血液)樣本中存在冠狀病毒。第二批中的三個(gè)肺組織樣本呈冠狀病毒陽(yáng)性。


  研究團(tuán)隊(duì)還聯(lián)系了廣州海關(guān)技術(shù)中心,該中心重新檢測(cè)在此前反走私行動(dòng)中查獲的5份存檔的穿山甲樣品,隨后也在這些樣本中發(fā)現(xiàn)了冠狀病毒。

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冠狀病毒圖譜,紅點(diǎn)為穿山甲冠狀病毒


  對(duì)比發(fā)現(xiàn),在這些穿山甲中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒的基因組,與新型冠狀病毒基因組相似率在85.5%—92.4%,并在系統(tǒng)進(jìn)化樹中代表了新型冠狀病毒的兩個(gè)亞型。其中GD/P1L和GD/P2S兩個(gè)分支被認(rèn)為與新冠病毒密切相關(guān)。


  值得注意的是,新冠病毒與穿山甲冠狀病毒的受體結(jié)合域的氨基酸序列相似性高達(dá)97.4%。


  其中與細(xì)胞結(jié)合受體組合最關(guān)鍵的5個(gè)氨基酸序列組合上,兩者結(jié)果一致。而這5個(gè)核心氨基酸序列此前尚未在除新冠病毒以外的其他病毒中發(fā)現(xiàn)。


  但相比之下,蝙蝠冠狀病毒與新冠病毒的受體結(jié)合域的氨基酸相似度要更低,僅為89.2%。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,穿山甲冠狀病毒并非新冠病毒的最接近親緣關(guān)系。因此,研究團(tuán)隊(duì)推測(cè),廣東穿山甲冠狀病毒與新冠病毒之間的氨基酸相似性可能是由于趨同進(jìn)化而不是重組引起的。


  簡(jiǎn)而言之,與蝙蝠冠狀病毒相比,穿山甲冠狀病毒與新冠病毒相似度更高,并且在關(guān)鍵的受體結(jié)合部分,5個(gè)關(guān)鍵的氨基酸序列組合一致。


  穿山甲也是除蝙蝠以外唯一被新冠病毒相關(guān)冠狀病毒感染的哺乳動(dòng)物。但在穿山甲冠狀病毒與新冠病毒之間是否還有中間進(jìn)化的冠狀病毒,目前尚不得而知。(記者 謝欣)


  轉(zhuǎn)自:界面新聞

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