我國科學(xué)家完成海灣紫扇貝基因組測序和組裝

　　近日，記者從青島農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉，該校海洋科學(xué)與工程學(xué)院王春德教授課題組與合作單位自主研發(fā)完成海灣扇貝兩個(gè)亞種的基因組測序和組裝。近日，相關(guān)研究成果在線發(fā)表在Nature旗下開源期刊Scientific Data上。

　　此前，王春德課題組已完成紫扇貝基因組的測序和組裝。紫扇貝和海灣扇貝兩個(gè)亞種基因組的成功測序，為從分子水平解析海灣扇貝屬扇貝及其雜交后代的生長、抗逆性、育性和壽命等重要性狀的決定機(jī)制及分子育種，打下了基礎(chǔ)。

　　王春德表示，此次他們科研團(tuán)隊(duì)在扇貝育種研究方面再次取得重要進(jìn)展，成功完成海灣扇貝北部亞種和南部亞種基因組的測序和分析。

　　王春德介紹，海灣扇貝屬(Argopecten)是原產(chǎn)于美洲的雌雄同體型扇貝，大部分種類分布在北大西洋沿岸，其中海灣扇貝北部亞種和海灣扇貝南部亞種(又稱墨西哥灣扇貝)已由張福綏院士分別于1982年和1991年由美國引進(jìn)我國，成為我國北方和南方海域主要扇貝養(yǎng)殖品種。紫扇貝是唯一分布于南太平洋沿岸的海灣扇貝屬種類，2007年由王春德教授課題組首次從秘魯引進(jìn)我國。近年來，課題組通過將紫扇貝與海灣扇貝兩個(gè)亞種分別進(jìn)行雜交，成功培育出一系列生長優(yōu)勢極其顯著的雜交扇貝新品種(品系)，其中扇貝“渤海紅”“青農(nóng)2號”和“青農(nóng)金貝”已獲得國家水產(chǎn)新品種證書，成為我國北方的主要扇貝養(yǎng)殖品種，并在福建、廣西和廣東等南方海域養(yǎng)殖成功。

　　王春德課題組利用二代和三代測序相結(jié)合的方法測序并組裝了海灣扇貝兩個(gè)亞種的基因組。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示，海灣扇貝兩個(gè)亞種先聚為一支，然后與蝦夷扇貝聚為一支，再與其他雙殼類聚為一支，然后再與腹足綱物種聚類。兩個(gè)海灣扇貝亞種的分歧時(shí)間為2640萬年前，與蝦夷扇貝的分歧時(shí)間為8590萬年前。

　　轉(zhuǎn)自：科技日報(bào)

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