生物催化研究獲重大突破


作者:仲科    時(shí)間:2015-03-11





  近日,中國(guó)科學(xué)院上海有機(jī)化學(xué)研究所生命有機(jī)化學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員劉文領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì),經(jīng)過(guò)長(zhǎng)達(dá)12年的努力,在螺環(huán)乙酰乙酸內(nèi)酯/內(nèi)酰胺抗感染抗生素的生物合成中發(fā)現(xiàn)了兩種不同的酶,可以極大地促進(jìn)[4+2]D-A環(huán)化反應(yīng)(狄爾斯-阿爾德反應(yīng),Diels-Alder反應(yīng))的發(fā)生。該發(fā)現(xiàn)為證實(shí)D-A反應(yīng)酶的天然存在提供了有力的證據(jù)。相關(guān)成果已于3月3日在線發(fā)表在《自然-化學(xué)生物學(xué)》雜志上。

  文章點(diǎn)評(píng)中預(yù)期,以?xún)蓚€(gè)酶催化的串聯(lián)[4+2]環(huán)加成反應(yīng)為中心的合成策略如能有效運(yùn)用,將極大地促進(jìn)以多樣性為導(dǎo)向的生物和化學(xué)合成手段的發(fā)展,通過(guò)建立相應(yīng)天然產(chǎn)物的類(lèi)似物分子庫(kù),可以應(yīng)對(duì)藥物化學(xué)研究中對(duì)于分子結(jié)構(gòu)多樣性的要求和化學(xué)生物學(xué)研究中對(duì)于特異性分子探針的制備需求。

  據(jù)了解,合成化學(xué)中的D-A反應(yīng)屢見(jiàn)不鮮,但自然界中是否存在能夠催化D-A反應(yīng)的酶,多年來(lái)一直是生物學(xué)家和化學(xué)家爭(zhēng)論和懸而未決的焦點(diǎn)科學(xué)問(wèn)題。

  據(jù)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人劉文介紹,作為一種碳碳鍵構(gòu)建極為有效的手段,科學(xué)家們?cè)缫杨A(yù)言D-A反應(yīng)可能參與了具有環(huán)己烯單元的大量天然產(chǎn)物的生物合成,并且通過(guò)人為手段創(chuàng)造了能夠催化簡(jiǎn)單D-A反應(yīng)的抗體酶或核酶。但是,目前自然界中發(fā)現(xiàn)的能夠促進(jìn)[4+2]D-A環(huán)化反應(yīng)的天然酶蛋白僅有5例。而且,它們?cè)诖祟?lèi)轉(zhuǎn)化中是否存在催化功能的爭(zhēng)論依舊。原因是這些酶或者具有多種功能,或者催化效率很低,或者相應(yīng)的反應(yīng)根本不需酶就可以自發(fā)進(jìn)行,使相關(guān)的機(jī)制研究尤為困難,導(dǎo)致數(shù)十年來(lái)人們無(wú)法確切地判斷D-A反應(yīng)酶是否天然存在。劉文團(tuán)隊(duì)最近的發(fā)現(xiàn)為回答這一科學(xué)難題創(chuàng)造了有利的契機(jī)。

  事實(shí)上,自然界中螺環(huán)乙酰乙酸內(nèi)酯/內(nèi)酰胺抗生素產(chǎn)生于各種來(lái)源的微生物,目前該家族已有數(shù)十個(gè)成員的化學(xué)結(jié)構(gòu)得以確證。這些抗生素具有強(qiáng)烈的抗感染、腫瘤抑制等重要的生物活性,長(zhǎng)期以來(lái)一直是生物學(xué)、藥學(xué)和化學(xué)領(lǐng)域共同關(guān)注的研究熱點(diǎn)。然而由于結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性,化學(xué)合成或修飾往往面臨產(chǎn)率和效率方面的嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。

  劉文團(tuán)隊(duì)的研究發(fā)現(xiàn),所有螺環(huán)乙酰乙酸內(nèi)酯/內(nèi)酰胺成員均采用了相似的生物合成策略,即通過(guò)酶促的[4+2]環(huán)加成反應(yīng)完成線性中間體的剛性交聯(lián);兩個(gè)不同酶催化的環(huán)化反應(yīng)可以偶聯(lián)也可以去偶聯(lián),從而解釋了自然界中如何創(chuàng)造核心骨架相似、但整體結(jié)構(gòu)不同的抗生素分子。(仲科)

來(lái)源:中國(guó)化工報(bào)



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