自閉癥基因組學(xué)研究獲新突破


時(shí)間:2013-07-17





  在最新一期《美國(guó)人類遺傳學(xué)》(The American Journal of Human Genetics,2013 July 11.pdf.)雜志上發(fā)表的一篇文章中,美國(guó)杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院、多倫多兒童醫(yī)院以及深圳華大基因研究院等多家單位通過(guò)全基因組測(cè)序的方法成功鑒定出一系列與自閉癥相關(guān)的遺傳突變和風(fēng)險(xiǎn)基因。該研究成果為自閉癥研究提供了寶貴的遺傳資源,同時(shí)或?qū)⒊蔀樘剿髯蚤]癥病理機(jī)制及開發(fā)新的治療手段極為關(guān)鍵的一步。

  自閉癥的主要病癥包括不正常的社交能力、溝通能力、興趣及行為模式,其病因尚不明確,但發(fā)現(xiàn)自閉癥表現(xiàn)出很高的可遺傳性及家族聚集性。由于其臨床和基因組學(xué)異質(zhì)性,其遺傳基礎(chǔ)目前尚不清楚。之前有研究證實(shí)突觸后蛋白SHANK3在正常的神經(jīng)連接發(fā)育中起關(guān)鍵性的作用,Shank3基因突變可導(dǎo)致小鼠出現(xiàn)自閉癥樣行為及紋狀體異常。

  全基因組測(cè)序能夠?yàn)殍b定自閉癥的新的風(fēng)險(xiǎn)基因以及新生突變提供有價(jià)值的信息,但是目前尚未有從全基因組水平對(duì)自閉癥做出全面評(píng)價(jià)。因此,在這項(xiàng)研究中,研究人員對(duì)32個(gè)自閉癥家系進(jìn)行了全基因組測(cè)序研究,并在全基因組范圍內(nèi)對(duì)單堿基突變(SNV)、拷貝數(shù)變異(CNV)以及插入/缺失(indel)等進(jìn)行檢測(cè),用以鑒定與自閉癥相關(guān)由于功能缺失或錯(cuò)義變化而有害的新生突變或罕見的遺傳性突變。

  研究人員在自閉癥先證者中鑒定出19%的新生突變以及31%的伴X染色體或常染色體遺傳性變異。所鑒定出的純系突變比例高于以往的研究報(bào)道,這表明全基因組測(cè)序更全面的覆蓋到所有位點(diǎn),同時(shí)本研究還進(jìn)行了外顯子測(cè)序,相比之下,全基因組測(cè)序能夠更好的對(duì)與自閉癥相關(guān)的基因進(jìn)行檢測(cè)。

  在這項(xiàng)研究中,研究人員共在9個(gè)過(guò)去已知的與自閉癥相關(guān)的基因、4個(gè)新發(fā)現(xiàn)的自閉癥基因以及8個(gè)候選自閉癥風(fēng)險(xiǎn)基因上鑒定出有害的突變。比如與FMR1相配位參與脆性X染色體綜合征的CAPRIN1和AFF2,與社會(huì)認(rèn)知缺陷相關(guān)的VIP基因,能夠造成與自閉癥相關(guān)的CHARGE綜合征的CHD7基因以及SCN2A、KCNQ2、NRXN1等。

  研究還指出,自閉癥全基因組測(cè)序的結(jié)果可能有助于自閉癥的早期診斷。比如,攜帶有諸如SCN2A和CAPRIN1等新生突變的先證者家族中,后代中再次發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)和其他群體相似;而攜帶有一些罕見遺傳變異,如CACNA1C、CHD7、KCNQ2,則出現(xiàn)自閉癥的風(fēng)險(xiǎn)較大。同時(shí)伴X連鎖基因發(fā)生突變也解釋了自閉癥患者中男性患者居多。此外,所鑒定出的遺傳突變也是很多藥物設(shè)計(jì)的潛在分子靶點(diǎn),能夠?yàn)樽蚤]癥的個(gè)性化治療打開大門,比如VIP基因、KCNQ2等。

  研究人員表示,“全基因組測(cè)序是一種強(qiáng)有力的工具,可以加速開發(fā)新的診斷和治療手段,從而改善自閉癥患者及其家庭的生活。自閉癥的早期診斷非常重要,有助于患有自閉癥的兒童在語(yǔ)言和社會(huì)能力上獲得顯著改善?!?/p>


來(lái)源:藥品資訊網(wǎng)信息中心



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