計(jì)算機(jī)模擬有助于研究細(xì)菌的耐藥性


時(shí)間:2011-07-26





據(jù)悉,一個(gè)關(guān)于氨基糖甙類抗生素與它們?cè)诩?xì)菌的作用位點(diǎn)之間相互作用的最新研究使用了計(jì)算機(jī)模擬來(lái)闡明這個(gè)機(jī)制,從而建議藥物的修飾。

在這篇于7月21日發(fā)表在開放期刊《PLoS Computational Biology》上的文章中,波蘭華沙大學(xué)以及美國(guó)加州大學(xué)圣地亞哥分校的研究人員描述他們的細(xì)菌耐藥機(jī)制的物質(zhì)基礎(chǔ)研究-抗生素的作用靶點(diǎn)即細(xì)菌核糖體RNA的突變。他們進(jìn)行了模擬并觀察到了當(dāng)發(fā)生不同的突變時(shí),抗生素和作用位點(diǎn)的相互作用的變化。

在世界各地的醫(yī)院,氨基糖甙類抗生素被用于甚至是最嚴(yán)重的細(xì)菌感染,這是非常成功的,特別是針對(duì)結(jié)核病和鼠疫。然而,耐藥菌的不斷出現(xiàn)已經(jīng)使改進(jìn)這些抗生素成為迫切的需要。對(duì)細(xì)菌以往的實(shí)驗(yàn)已經(jīng)證明,細(xì)菌核糖體RNA的特定的點(diǎn)突變賦予了對(duì)氨基糖苷類的高耐藥性。然而,這種影響的潛在物理化學(xué)機(jī)制尚未明確。利用計(jì)算機(jī)模擬,研究人員解釋了在這個(gè)特定的RNA片段的不同突變是如何影響其動(dòng)力學(xué)并導(dǎo)致耐藥性的。

細(xì)菌還有獲得耐藥性的其他方式,而不僅僅是通過(guò)突變,進(jìn)一步的研究正在進(jìn)行中。作者現(xiàn)正在研究通過(guò)哪種酶修飾和中和氨基糖甙類抗生素而產(chǎn)生耐藥的機(jī)制。這些分子模擬研究與實(shí)驗(yàn)可以有助于在將來(lái)設(shè)計(jì)更好的氨基糖苷類衍生物。


來(lái)源:前沿醫(yī)學(xué)



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