AB SCIEX創(chuàng)新蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜新技術(shù)


時(shí)間:2011-06-09





  蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院及ABSCIEX全球領(lǐng)先的生命科學(xué)分析技術(shù)公司的科學(xué)家匯聚一堂,公布一項(xiàng)基于質(zhì)譜應(yīng)用的新技術(shù),利用此項(xiàng)技術(shù),科學(xué)家有史以來(lái)首次可以獲得單獨(dú)蛋白質(zhì)組學(xué)樣品分析中每個(gè)肽段的數(shù)據(jù)。SWATH采集模式是一項(xiàng)重大技術(shù)突破,使用質(zhì)譜研究蛋白質(zhì)組學(xué)的用戶得以獲知整個(gè)蛋白質(zhì)組的完整數(shù)據(jù)。在與蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院RuediAebersold博士進(jìn)行的MRMAtlas合作的過(guò)程中,ABSCIEX將開(kāi)發(fā)MS/MSALL增強(qiáng)功能,使ABSCIEXTripleTOF?5600系統(tǒng)可以運(yùn)行SWATH采集模式供全球科學(xué)家使用。有關(guān)SWATH的詳情將于本周在丹佛召開(kāi)的美國(guó)質(zhì)譜協(xié)會(huì)AmericanSocietyofMassSpectrometry,ASMS會(huì)議上公布。

  SWATH采集模式是Aebersold博士及其在蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的團(tuán)隊(duì)共同開(kāi)發(fā),為未來(lái)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供的一種新的工作流程,該系統(tǒng)預(yù)計(jì)將產(chǎn)生令人震撼的蛋白質(zhì)組學(xué)新發(fā)現(xiàn),并克服目前的質(zhì)譜平臺(tái)中因數(shù)據(jù)重復(fù)而給科學(xué)家?guī)?lái)的困惑。本技術(shù)關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)在于其能提供樣品的完整定量與定性結(jié)果,該結(jié)果能按照提出的新假設(shè)經(jīng)電腦模擬進(jìn)行回溯性的挖掘。

  這一新技術(shù)是對(duì)MRMAtlas的完美補(bǔ)充,MRMAtlas以質(zhì)譜技術(shù)為基礎(chǔ),向大多數(shù)人類蛋白質(zhì)組提供研究平臺(tái)。全球科學(xué)家利用這一圖譜極大推進(jìn)了生物標(biāo)志物研究、蛋白藥物開(kāi)發(fā)、基礎(chǔ)生物及生物醫(yī)學(xué)研究。MRMAtlas提供簡(jiǎn)單及有效分析能力,探索蛋白質(zhì)組中前所未見(jiàn)的新領(lǐng)域。利用TripleTOF5600系統(tǒng)的SWATH采集模式,將有更多科學(xué)家能使用MRMAtlas。

  現(xiàn)有高分辨率及軌道阱質(zhì)譜系統(tǒng)僅能定性檢測(cè)出復(fù)雜樣品中的蛋白質(zhì)子集,因?yàn)樗鼈僊S/MS獲取速度相對(duì)較慢,且為探知更準(zhǔn)確的定量結(jié)果,常常會(huì)采用其他儀器再次進(jìn)樣分析樣品。面對(duì)這些挑戰(zhàn),ABSCIEX開(kāi)發(fā)出SWATH采集模式可以在單一進(jìn)樣分析中同時(shí)對(duì)所有蛋白質(zhì)與肽進(jìn)行定量與定性檢測(cè)。

  與Aebersold博士及其團(tuán)隊(duì)共同展開(kāi)的這一活動(dòng)還將繼續(xù)開(kāi)發(fā)軟件處理方法,更好解析MRMAtlas的數(shù)據(jù)。SWATH采集模式是ABSCIEX的MS/MSALL技術(shù)的延伸,只能在TripleTOF?5600上完成,這是因?yàn)樾枰獙O高的采集速度與定量能力、精確質(zhì)量及高分辨率整合在一起方可實(shí)現(xiàn)。MS/MSALL以前已成功用于脂質(zhì)組學(xué)及特種結(jié)構(gòu)表達(dá)?,F(xiàn)在進(jìn)一步擴(kuò)展此能力,MS/MSALL采用SWATH采集模式,極大提高了工作效率,因此可以結(jié)合LC/MS--,顯著提高了質(zhì)譜技術(shù)。

  瑞士聯(lián)邦理工學(xué)院蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院分子系統(tǒng)生物學(xué)學(xué)院RuediAebersold博士、教授

  “利用SWATH和MRMAtlas,我們能夠重新思考研究蛋白質(zhì)組學(xué)的方法。我們能夠利用前所未有的方法研究樣品,我們預(yù)計(jì)這將產(chǎn)生令人震撼的新發(fā)現(xiàn)。與ABSCIEX合作使我們達(dá)到開(kāi)發(fā)此項(xiàng)技術(shù)所必須的速度與定量層次,我們將向全球整個(gè)科學(xué)界提供這一技術(shù)?!?/p>

  ABSCIEX制藥與蛋白質(zhì)組學(xué)業(yè)務(wù)部總經(jīng)理兼副總裁DaveHicks

  “ABSCIEX再一次與世界一流科學(xué)家緊密合作,推動(dòng)質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展,達(dá)到其他任何廠家均難以想象的高度。TripleTOF5600系統(tǒng)提供的能力和速度使這一革命性的SWATH技術(shù)成為現(xiàn)實(shí)。我們預(yù)計(jì)這一發(fā)展將在接下來(lái)的幾年中重振蛋白質(zhì)組學(xué)研究。”


來(lái)源:藥品資訊網(wǎng)信息中心



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