中外科學(xué)家發(fā)現(xiàn)主流疾病研究方法缺陷


時(shí)間:2010-10-11





  10月4日,由深圳華大基因與加州大學(xué)伯克利分校、哥本哈根大學(xué)等單位合作的研究成果“對(duì)200個(gè)人類外顯子的測(cè)序揭示大量低頻率非同義突變的存在”在國(guó)際著名學(xué)術(shù)雜志《自然·遺傳學(xué)》上發(fā)表。這是中外科學(xué)家在人類基因組研究領(lǐng)域取得的又一項(xiàng)重要成果。

  該研究對(duì)200個(gè)丹麥個(gè)體蛋白質(zhì)編碼基因的外顯子組進(jìn)行了深度測(cè)序,發(fā)現(xiàn)了大量以往未知的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)SNP,其中大部分在人群中都以較低頻率出現(xiàn)。該研究完成了目前在人類外顯子區(qū)域規(guī)模最大、分辨率最精細(xì)的遺傳圖譜,并以翔實(shí)的數(shù)據(jù)證明,人群當(dāng)中的低頻率多態(tài)性位點(diǎn)富集了大量能引起蛋白質(zhì)氨基酸序列改變的變異,而這類變異在人群中受到自然選擇作用,可能具有影響人類健康的功能。

  最近有多項(xiàng)科學(xué)研究指出,以往對(duì)多基因控制的復(fù)雜疾病所進(jìn)行的關(guān)聯(lián)分析研究盡管從理論上可行,并在實(shí)踐中發(fā)現(xiàn)了許多疾病關(guān)聯(lián)基因,但卻僅能解釋復(fù)雜疾病遺傳性的一小部分。這一現(xiàn)象被稱為“遺傳度缺失”,是當(dāng)前復(fù)雜疾病基因組研究的一個(gè)主要難題。此研究首次證實(shí),影響人類健康和疾病易感性的多態(tài)性位點(diǎn)在人群中往往頻率低,但是相關(guān)位點(diǎn)的個(gè)數(shù)很多。既往的復(fù)雜疾病關(guān)聯(lián)分析使用的基因分型芯片僅對(duì)常見多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行測(cè)定,而無法研究低頻率多態(tài)性位點(diǎn),從而漏掉大量疾病關(guān)聯(lián)位點(diǎn),造成“遺傳度缺失”。該研究不僅指出了目前主流疾病研究方法的缺陷,并顛覆性地提出疾病關(guān)聯(lián)分析應(yīng)充分使用測(cè)序技術(shù)而非基因分型技術(shù),從而對(duì)改變科學(xué)家對(duì)復(fù)雜疾病的研究手段,推動(dòng)人類健康與醫(yī)學(xué)研究的進(jìn)步具有里程碑意義。

來源:藥品資訊網(wǎng)信息中心



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