首個普通野生稻全基因組框架圖譜繪制完成

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　　中科院昆明植物研究所研究員高立志及團(tuán)隊(duì)宣布，運(yùn)用新一代高通量測序技術(shù)以及基于高性能超算的生物信息學(xué)分析，日前已完成普通野生稻基因組高覆蓋的序列測定、拼接和組裝工作，獲得了普通野生稻全基因組從頭測序的框架圖，基因組圖譜已達(dá)到國際領(lǐng)先的基因組圖譜標(biāo)準(zhǔn)。這是我國科學(xué)家自主完成的第一個野生稻全基因組測序計(jì)劃，也是世界首個高雜合度野生稻全基因組框架圖譜。

　　中國是亞洲栽培稻的起源地之一，水稻是中國第一大糧食作物，養(yǎng)活了80%以上的中國人口。普通野生稻是亞洲栽培稻的公認(rèn)祖先種，被列為國家二級保護(hù)植物，蘊(yùn)藏著許多尚未認(rèn)識與利用的優(yōu)異基因。由于它與栽培稻有著密切的親緣關(guān)系，迄今水稻常規(guī)育種取得的大多數(shù)突破無不與發(fā)掘利用該種野生稻的優(yōu)異基因相關(guān)。例如，袁隆平等利用海南島的一株雄性不育普通野生稻野敗中的細(xì)胞質(zhì)雄性不育基因，育成了聞名中外的雜交水稻。

　　此前，粳稻日本晴基因組的精細(xì)圖譜已經(jīng)獲得，秈稻9311基因組的框架圖譜也由我國科學(xué)家完成?，F(xiàn)在普通野生稻全基因組框架圖譜的獲得以及精細(xì)圖譜的進(jìn)一步繪制，不僅大大地促進(jìn)水稻重要功能基因的規(guī)?；馕雠c鑒定，為進(jìn)一步發(fā)掘利用普通野生稻豐富的優(yōu)異基因資源提供了前所未有的機(jī)遇。

　　本項(xiàng)目的完成主要依托于2009年年底順利通過國家驗(yàn)收的國家大科學(xué)工程中國西南野生生物種質(zhì)資源庫先進(jìn)的基因組學(xué)與生物信息學(xué)平臺。測序結(jié)果已覆蓋92%的普通野生稻全基因組，基因覆蓋度約為90%以上。目前，項(xiàng)目組正在加緊繪制普通野生稻的基因組精細(xì)圖譜。

來源：藥品資訊網(wǎng)信息中心

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